1、遗传因素：据调查，强直性脊柱炎患者亲属中发病率比一般人高30倍左右。有人研究发现，多对孪生兄弟先后出现强直性脊柱炎。强直性脊柱炎患者HLA-B27(人类白细胞抗原B27)阳性率高达90%以上，但正常人群中亦有4%~6%呈HLA-B27阳性，因此HLA-B27阳性的人，不一定患强直性脊柱炎，医生从来不单独依据HLA-B27阳性来诊断本病。也说明在发病因素中还有其他因素起作用。
2、感染因素：有些学者经过大量观察发现，不少男性强直性脊柱炎患者合并有前列腺炎。另外有一些研究发现，本病患者中溃疡性结肠炎和局限性肠炎的发病率较一般人高，从而推测致病因素可能是感染。
3、自身免疫：有人发现强直性脊柱炎患者的血清补体增高，大部分病例有IgA型类湿因子，血清C4和IgA水平显著增高，血清中有循环免疫复合物(CIC)，但抗原性质未确定。因此，这是导致强直性脊柱炎的病因之一。
4、内分泌失调或代谢障碍：由于类风湿多见于女性，而强直性脊柱炎多见于男性，故被认为内分泌失调与本病有关。
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